Moin, unter Windows 2000 / XP ist die maximale Größe einer FAT32 Partition auf 32GB beschränkt, auch wenn es ansich möglich ist größere FAT32 Partitionen anzulegen. Das sollte zB. mit Linux oder über DOS möglich sein. Wenn erstmal eine entsprechend große und formatierte Partition vorhanden ist, kann Windows auch damit umgehen, es ist wie gesagt nur nicht möglich sie selbst unter Windows zu formatieren. Ich schätze mal das ist der Fall bei dir.
Ansonsten musst du vieleicht mal die Einstellungen für die erste Festplatte auf die zugegriffen werden soll, im BIOS überprüfen. Zumindest wenn der Rechner neu aufgebaut ist oder vorher eine PATA Platte in betrieb war, kann das im BIOS noch falsch eingestell sein.